Zespół mikroorganizmów żyjących w jelitach tworzy mikroflorę jelitową, zwaną także mikrobiotą jelitową lub florą jelitową. Nasza mikrobiota jelitowa odgrywa bardzo ważną rolę w odżywianiu i metabolizmie pokarmów. Mikrobiom jelitowy stanowi również część bariery jelitowej, która zapobiega kolonizacji lub nadmiernemu rozwojowi niekorzystnych bakterii, a także prawidłowemu funkcjonowaniu układu odpornościowego. Niektóre sytuacje mogą zaburzyć równowagę mikrobiomu jelitowego, zakłócając prawidłowe funkcjonowanie układu trawiennego. Do czynników, które mogą powodować tę nierównowagę, należą m.in. zmiany równowagi jelitowej wywołane sporadyczną biegunką wywołaną przez wirusy lub bakterie, przyjmowanie antybiotyków, które mogą oddziaływać na mikroorganizmy tworzące mikrobiotę jelitową, sytuacje stresowe oraz podróże. W takich przypadkach należy natychmiast podjąć działania mające na celu ochronę flory jelitowej.
